MELD评分在2016年获得更新

OPTN/UNOS(美国器官获取和移植网络/器官资源共享网络)在2016年年初更新了MELD评分的计算方式,将患者的血清钠水平纳入了新的评分系统,被称为MELD-Na。新的评分将用于肝移植供体的分配。随着新评分的推广使用,以后应该会直接叫做MELD。MELD-Na是在原有的MELD评分(MELD(i))基础上进一步计算,计算公式是:

MELD-Na = MELD(i) + 1.32 x (137-Na) – [0.033 x MELD(i)*(137-Na)]

如果血清钠低于125 mmol/L,则被设定为125;如果高于137则被设定为137。其他没有更新。

MDCalc的在线计算器已经做了更新,可以直接使用。

Endnote X6新特性小结

我是从X4版本跳过了X5直接升级到X6的。就不看更新日志,直接从我个人的感觉看这个版本带来了什么新特性了。先来个截图:

2012-08-22_endnote_x6

  1. 版式改变:这应该是最大的变化。以前条目栏和预览/pd浏览栏目是上下式的布局显示的,现在默认改成了左右栏显示,这对于大的宽屏显示器非常实用。当然,软件保留了老的布局,以适合小的显示器,例如笔记本。另外,将Search Panel放到了页面的上方,并且可以一键隐藏。这个改变也更符合搜索习惯,毕竟多数搜索引擎的对话框都放在页面上方。默认字体大小变成了8号字,密密麻麻的文字看起来很专业,但就是比较费劲,当然这点可以在首选项里更改。
  2. 增加已读状态和raing的字段:未读的条目以粗体字显示,可以一键设置为已读状态。增加了rating,这点很好,可以根据用户自己的评估标准(如论文的重要性和跟自己专业的相关性)进行分级,便于快速找到最重要的文献。并且可以以rating为字段限制搜索结果。
  3. 大窗口浏览pdf:可以在大窗口整页面中打开pdf文档,这无疑更有利于阅读,以前将pdf的浏览嵌在窗口以内,几乎没有实用性,而现在的感觉更像是一个全功能的pdf阅读器了(包括一些简单的标注功能),虽然有些卡顿。期待财大气粗Thomson能收购一些pdf阅读器团队(例如x-change viewer),好好完善一下这个模块。
  4. 在reference的编辑页面,增加了字母编辑的按钮,可以快速的将字母全部大写、全部小写、符合标题格式的首字母大写等等。
  5. EndNote本地数据库与EndNote Web的同步,这点我用不了,原因你懂滴。
  6. 专门回去看了一下X5的更新日志,倒没看到什么新奇的更新,主要印象是全面去挖Reference Manager的墙角去了,另外footnote的灵活性也增加了不少,这需要在Output style的编辑里慢慢体会。

EndNote X5实用改进和更新

EndNote的升级速度之快有目共睹。虽然科研人员时间没那么宝贵,但能省一点是一点儿。这个可以极大的提高管理文献的工具也就值得好好学习。今天抽时间把EndNote X4升级到了X5,并仔细的看了一下What’s Now信息,把这个版本实用的改进和应用做了一些揣摩,并列举如下。如果你觉得哪个功能对你很重要,那就赶紧升级吧。

1、改善自动获取题录的形式。去年X4更新时,曾经写过一篇日志介绍新特性,其中最实用的就是pdf文档的直接导入功能。简单的说,就是在导入pdf文件时,EndNote自动联网匹配对应的题录信息(大多数pdf文档可以正确的匹配到题录信息),避免自己手工联网寻找对应的题录。但在X4里,这个功能存在缺陷,匹配的题录的杂志名是全称,而不是PubMed标准的缩写(例如获得杂志名是Nature Medicine而不是Nat Med)。但实际引用该条目时,只需要杂志名的简称就行了。现在X5已经改善了该功能,只获取杂志的简称而不是全名。另外,获得作者也不是全名,而是更为实用的简称了。

2、增加了更新题录的功能。选择单个题录,右键弹出菜单里选择“Find Reference Update”后就可以对以往的题录进行自动更新。这个功能非常有用,因为常常文献库里常常有一些没有正式出版的文献,这些文献还没有分配卷、期和页码,但在实际引用时,该文献已经正式发表,就需要提供卷期页码信息。如果自己手工的更新题录,无疑会很费时,现在直接点几次按键就可以完成了。对于以前使用pdf自动导入功能,自动获取题录里的杂志名是全称的条目,也可以以这个方法进行更新,获得杂志的简称。

3、增加缺失字段的替代功能。同样对于引用未正式出版的文献的提升,在引用无卷、期和页码的条目时,通常需要提供该文献的DOI来,例如这篇文献在引用时还没有正式出版,会引用成这个模样:
Daenen LGM et al: Chemotherapy enhances metastasis formation via VEGFR-1-expressing endothelial cells. Cancer Research 2011.
现在对这个style重新编辑,在Bibliography一栏的Field Substitution里勾选第3个选项“If the Volume and Pages fields are empty, use:”其他的默认就行。更新后的style会显示成:
Daenen LGM et al: Chemotherapy enhances metastasis formation via VEGFR-1-expressing endothelial cells. Cancer Research 2011, 10.1158/0008-5472.can-11-0627.
就是增加了DOI的号码。还有几个其他的不全字段的替代功能,只有这个最有用。需要的时候可以再琢磨。

4、集成PDF浏览和标注功能。将以前的Quick Edit标签(对条目的Auther、Year、Title等题录信息进行快速编辑)升级成“PDF & Quick Edit”标签,可以在这个tab里快速对附件里的pdf文档进行浏览、搜索、标注等;通过调整这个标签的大小和分栏,也可以获得满意的浏览效果,尤其在宽屏显示器上。

5、改善的引用方式。在写综述时,经常在文中里这样描述,Zhu et al (2006) found that…云云,最典型的就是Cell系列的综述这么做。以往只好手工的进行调整,现在这样子做变得简单了,直接在插入参考文献时点击Find Citation按钮,在弹出对话框里找到需要的文献,在Insert按钮旁的下箭头下拉里选择“Insert & Display As: Author (Year)”即可。如下图:

2011-11-20_auther_year_mode

 

6、本地的EndNote数据库和EndNote Web之间互传。有些云同步的意思,不过我没法升级我的EndNote Web帐号,没办法将附件传到网络上,但可以顺利的上传和下载题录信息。

AASLD肝癌诊疗指南更新提要

Hepatology 2010:1020 DOI: 10.1002/hep.24199

2005年AASLD(美国肝病研究协会)发布了肝癌诊疗指南。根据新出现的临床证据,去年对指南做了更新,全文下载链接在此。这篇短评则将其中的更新要点提了出来。主要更新如下:

筛查和诊断:

  1. 对慢性乙肝或丙肝患者,进一步肯定了筛查的价值;
  2. AFP因为敏感性和特异度不高,不再作为筛查的指标;
  3. 对于高危患者,推荐每6个月进行一次的超声筛查;
  4. 超声造影(CEUS)不能作为一种诊断手段,因为对于肝内胆管细胞癌患者会呈现假阳性;
  5. 限制了动态成像(dynamic imaging)的应用,咱们不存在这个问题,不多说;
  6. 对于小病灶的穿刺活检,可以借助磷脂酰肌醇聚糖(glypican)3,热休克蛋白70和谷氨酰胺合成酶的染色,以帮助诊断。

分期和治疗:

  1. BCLC成为一个事实的分期标准;
  2. 还没有可靠的数据来证明扩大肝癌肝移植的纳入标准是可行的;
  3. 日本的研究证实,门脉压力可以预测患者预后,从而帮助选择接受肝切除的患者;
  4. Y90的放疗栓塞报道很多,但是还没有随机对照的数据证实这种方法优于化疗栓塞(TACE);
  5. 索拉非尼已经成为晚期患者的标准治疗,不再累述。

肝癌阅读提要更新(2011-3-2):筛查、肝脏坚硬度

5.  El-Serag HB, et al. Effectiveness of AFP and ultrasound tests on hepatocellular carcinoma mortality in HCV-infected patients in the USA. Gut 2011. DOI: 10.1136/gut.2010.230508

对于慢性乙肝或丙肝的患者,对肝癌的常规筛查是非常有必要的。肝脏超声检查是目前广泛认可的筛查项目,而血清甲胎蛋白(AFP)的检查则存在争议。但如果不计较成本,增加AFP的检查应该会更加有益。

本研究来自于贝勒医学院,有1480名罹患丙肝相关肝癌的的退伍老兵纳入本研究,作者了解他们在诊断肝癌前两年内接受超声或AFP检查的情况,并分析接受这些检查与诊断肝癌的相对时间和检查的项目与患者的生存率之间的关系。作者发现在诊断肝癌前的两年内有77.8%的患者至少接受过一种检查,而这两年内每年都同时接受AFP和超声检查的患者仅有2%接受筛查的患者,死亡风险明显降低。在诊断前半年内和半年以上两个时间段内,至少接受一种检查的患者,死亡风险下降至0.71(95%CI,.62-0.82)。在诊断前半年内接受过两种检查的患者死亡风险下降为0.76,在半年前接受过两种检查的风险则为0.81。

总而言之,慢性丙肝患者的筛查现状不容乐观;筛查是明确有益的。

6. Jung KS, et al. Risk assessment of hepatitis B virus-related hepatocellular carcinoma development using liver stiffness measurement (FibroScan). Hepatology 2011;53:885-894. DOI: 10.1002/hep.24121

传统评估肝纤维化的手段是肝脏的穿刺活检,肝穿的风险是显然的;FibroScan则是一种无创、无痛评估肝脏纤维化状态的方法,其测量的数值被称为肝脏坚硬度,无疑是一种非常优秀的替代。我们的常识是,随着肝脏纤维化硬化的进展,慢性肝炎患者的肝癌发生风险也逐渐增高。这个研究就是来把这个常识量化。作者对1130名平均年龄为50.2岁的慢性乙肝患者中位随访了30.7个月。这些患者中有59.5%的人曾经接受过或者正在接受抗病毒治疗。在随访过程中57名患者被诊断为肝癌,肝癌发病危险因素包括:年龄较高、男性、重度饮酒(每天酒精摄入大于80 g),血清白蛋白或HBeAg异常,当然,肝脏的坚硬度异常也是一个危险因素。这些患者的中位肝脏坚硬度是7.7 kPa,随着坚硬度提高,肝癌发病风险增加,如下为各个区间内的肝癌发病风险比:

  • 8-13:3.07
  • 13-18:4.68
  • 18-23:5.55
  • >23:6.60

EndNote X4版新特性简介(附与Word的冲突解决)

刚刚试用了一下EndNote X4,这个版本算是有了实质性的提升,提供了一些新的特性让我有些不能蛋定。 官方网站上提供了X4版的新特性视频介绍,可以去围观一下。这里讲讲我认为最激动人心的地方,那就是EndNote X4支持PDF文档的导入。

这不是简单的把pdf文档作为附件绑在某个文献条目后面,而是智能导入。导入pdf时,EndNote X4会遍历pdf文档,智能的找到文档的DOI号,从而与文献库里已经存在的条目智能的匹配;如果文献条目不存在,则根据DOI号码联网自动获取该pdf文档的作者、标题、杂志及年卷期等信息。自动获得条目信息不包括摘要,算是小遗憾。DOI相当于电子文档的身份证,每个文献的电子版(包括大多数中文文档哦)都有一个独立的DOI号码(详见官网的介绍),这就保证了批量导入(例如导入整个文件夹内的所有pdf文档)pdf文档时能做到与文献条目的正确匹配。但是对与NEJM的电子版是不灵的,因为这丫的在文档里不提供DOI编号。

此外,EndNote X4还支持对已导入文献库的pdf文档的全文检索,只需要将检索的field选择pdf,就可以做到全文检索了,再如下图所示。

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新版本介绍完毕。EndNote X3和X4版都与Word 2007的存在一点小冲突,表现为插入了EndNote参考文献的Word文档会变得奇慢无比,常常失去响应。我一度以为是跟Word的语法检查冲突,今天跟 @mrseacow 推友简单的交流后,我仔细的看了看,发现冲突其实只存在于Word 2007的“使用上下文拼写检查”。在Word里关掉这个选项便是。方法:Word 2007界面左上角的球 – Word 选项 – “校对”页 – 去掉“使用上下文拼写检查”前的勾。跟Word 2010可能也有类似的冲突,请自行测试。见下图所示:

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