独立的思考,成功能否有飞跃?
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EndNote X4版新特性简介(附与Word的冲突解决)
六 19th
刚刚试用了一下EndNote X4,这个版本算是有了实质性的提升,提供了一些新的特性让我有些不能蛋定。 官方网站上提供了X4版的新特性视频介绍,可以去围观一下。这里讲讲我认为最激动人心的地方,那就是EndNote X4支持PDF文档的导入。
这不是简单的把pdf文档作为附件绑在某个文献条目后面,而是智能导入。导入pdf时,EndNote X4会遍历pdf文档,智能的找到文档的DOI号,从而与文献库里已经存在的条目智能的匹配;如果文献条目不存在,则根据DOI号码联网自动获取该pdf文档的作者、标题、杂志及年卷期等信息。自动获得条目信息不包括摘要,算是小遗憾。DOI相当于电子文档的身份证,每个文献的电子版(包括大多数中文文档哦)都有一个独立的DOI号码(详见官网的介绍),这就保证了批量导入(例如导入整个文件夹内的所有pdf文档)pdf文档时能做到与文献条目的正确匹配。但是对与NEJM的电子版是不灵的,因为这丫的在文档里不提供DOI编号。
此外,EndNote X4还支持对已导入文献库的pdf文档的全文检索,只需要将检索的field选择pdf,就可以做到全文检索了,再如下图所示。
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新版本介绍完毕。EndNote X3和X4版都与Word 2007的存在一点小冲突,表现为插入了EndNote参考文献的Word文档会变得奇慢无比,常常失去响应。我一度以为是跟Word的语法检查冲突,今天跟 @mrseacow 推友简单的交流后,我仔细的看了看,发现冲突其实只存在于Word 2007的“使用上下文拼写检查”。在Word里关掉这个选项便是。方法:Word 2007界面左上角的球 – Word 选项 – “校对”页 – 去掉“使用上下文拼写检查”前的勾。跟Word 2010可能也有类似的冲突,请自行测试。见下图所示:
Moto Milestone:我的血泪刷机之路和推荐应用
六 9th
本想写写Android上的featured app的,结果发现其实Android上的范软其实不多,我理想中的笔记本软件和自动情景模式管理软件至今都没有找到。水木上PocketLife版有人用长文在写他怎么跟milestone的自动重启做斗争,我一时冲动也写了一下我的刷机血泪史,附带说说我的推荐应用。
我的Motorola Milestone从三月份中旬入手,到现在刷机次数应该有20次。
- 到手时js刷的是hiapk的降服顽石的汉化2.01 rom,不管三七二十一,刷了再开用。记不得什么rom用了一阵子,频繁重启,怀疑是连云助手的问题,卸载软件后,重启似乎少了点,但是没有杜绝。期间曾经刷了2.01的港版rom,英文界面,但是闹钟在飞行模式下失灵,其他还算稳定,用了挺久,只是要掏出我的palm做闹钟。
- 2.1 ROM出来了,尽管没有英文,又开刷了。其他都好,就是闹钟问题变得更加严重了,即使没有开飞行模式,闹钟一样不响。但是总有网友说他们的某某2.1 rom没有这个问题,无奈就跟着折腾。
这时候itfunz龙猪的rom开始冒尖,因为做了防止深度睡眠的改变,可以让闹钟响起来,不由分说,刷吧。 - 没几天,官方又把闹钟问题给解决了,刷吧。
- 发短信时回车就重复发送短信的bug存在,龙猪的异域风情开始折腾,忍不住诱惑,刷。
- 后来说德版的基带信号稳定,跟进,还不错,不过在上海市区有信号,郊区没有,地铁里没有。把我害惨了,一次跟老婆约好在地铁里一站见的,结果失去了联系。让我直想把机子给砸了。幸好龙猪已经考虑到了这个问题,让我这样菜鸟也可以简单的换基带。
- 后来发现GPS定位问题,基站定位也问题多多,老是把我定位在2km以外,烦啊。以为是基带更换后不兼容的问题,刷了个Canada的底包,加上龙猪的异域风情final,gps问题没有解决。只刷底包,不刷龙猪的rom,问题还没解决。不过因为未知原因,基站定位倒准确了,系统也挺稳定,将就着用吧。
- 前几天又来了个更新,使用的是UK的底包+黯然失色终结者,GPS问题果然解决了,但是自动重启严重,每天有1-1.5次的重启。今天干脆就重新来过,只刷了底包,保佑我,别出别的问题。
- (updated, 2010-6-18)事实证明,修改过的底包还是会出问题的,现在用官方的港版繁体中文ROM已经一两周,很好,很满意,详见另一篇日志。
频繁刷机其实不是为了中文系统,而是那些细微bug修复,不过现在看来大多是浮云,还是返回了官方的rom,就是所谓的底包。而且即使是号称干净的定制ROM,都会给带个UC浏览器,这点让我很难忍,因为我从来就不喜欢这个国产货。如果挂上这个东西,龙猪是不是可以获得一定的补偿,那我也无话可说。
回头想想,root权限对我而言根本就没什么用;联系人排序也是浮云,用hidialer可以很好的首字母定位联系人,系统搜索其实也很方便;插上耳机或者拔掉耳机音乐就会响起来,无所谓了,耳机基本上不用。现在最让我难以忍受的就是飞行模式掉电很多,不知道是不是我用了自动情景模式软件Setting Profile的缘故。
总体印象:1. Android有够折腾,开放性上去了,稳定性就下来了。 2. 在Android的BBS上求助,很难获得有质量的应答,这点跟玩Palm和PPC时差别很大。可能是rom太多,用户都分散了。
罗列一些我喜欢的应用:
- Laucher类的桌面软件,最喜欢的还是LauncherPro,这东西把Android的触摸体验提升了很多。
- 笔记软件:3banana,非常简洁的笔记软件,支持同步,可惜不支持加密,但用来做速记体验极好。EasyNote可以作为补充,支持对某个笔记本加密,可以用来写日记,但是个头大,速度慢,非常不符合我的审美,但是看在可以加密的份上也忍了。笔记软件还有EverNote,主要用来做资料库。
- 工作效率类:Setting Profile,这情景模式软件总还是差了一点,跟Palm OS上的PowerMan和PPC上的Spb Phone Suite差了很多。而且我怀疑这东西是飞行模式下电耗子,无奈,没有别的更好的选择;电话辅助还是最喜欢Hidialer(智能拨号),所有的需求都满足了;(updated, 2010-6-18)现在已经放弃了Setting Profile,使用Locale,结合Autopilot插件,可以很好的实现自动情景和飞行模式,已经成为了我理想中的情景管理软件。
- 桌面小工具:Weather Widget,桌面看即使天气和天气预报,有多个模式可以挑选;Pure Calendar Widget,我的最爱,这是我心中完美的日程显示方式。
- 网络类:rTerm用来上BBS,在milestone的屏幕和全键盘的配合下,体验很好;SugarSync,桌面和手机的同步,比DropBox体验要好的多,至少是真正的做到了多平台同步;迷你飞信,专门用来应付用飞信跟我的手机短信聊天的同学,哼哼;Twitter的一干客户端,最喜欢的还是Seesmic和Twigee;Simple Last.fm Scrobbler可以把我在手机上听的歌也记录到Last.fm上去。
使用IPP测定生物发光的光密度
四 28th
丁香园 hbchendl 网友提供的非常优秀的Image-Pro Plus(IPP)动画教程的这一章节找不到了(也许根本就没有这一段,是我记错了)。于是就自己摸索,折腾出这个办法,有些笨。留在这儿备查。有兴趣的朋友欢迎交流。
适用:基于化学发光原理的条带(如Western)和芯片(如抗体芯片)分析,当然PCR的电泳条带也可以。
1. 软件设置:Measure – Calibration – Intensity,New一个新的,选择Std. Optical Density,点击System按钮,设置为系统默认。简单说,就是点越黑,数值越高。Close关闭窗口。 ![]()
2. 选择需要测量的指标,包括面积和光密度:Measure – Count/Size,在弹出窗口Count / Size中选择Measure – Select Measurements,加入Area(默认已经添加)和IOD(“综合光密度”,包括了面积和光强度信息),OK关闭窗口;关闭Count / Size窗口。 ![]()
3. 打开图片,使用工具栏的方框、圆形或者不规则图标圈取感兴趣的区域(ROI),这里用圆形框选一个。注意不要把整个点覆盖到。为什么这样,不多解释。 ![]()
4. 点击工具栏Count and measure objects
图标,再次弹出Count / Size窗口,点击“Select Range…”按钮,弹出Segmentation窗口,将测量范围选择所有(两条红色竖线分别置于0和65535两个顶端),此时图片应该全部被红色覆盖(Class color)。Close关闭窗口。 ![]()
5. 回到Count / Size窗口,点击Count按钮计数,此时在ROI内会有1(测量的区域数目)并且标志红色框(测量区域)。菜单View – Statistics,获得Sum一栏的Area和IOD值,记下来(有能力可以Export Data到Excel文档,这里不详述)。
6. 测量另一个同等大小ROI的灰度值:关闭Statistics窗口,将ROI鼠标点击移动到另一个区域(鼠标指针变为十字形时,按下左键拖动到另一个区域,放下鼠标左键即可,1和红色框还留在原处,不需要管它),再次点击Count,然后View – Statistics,读取这个区域的Area和IOD的Sum值。如果保持ROI大小不变,Area值应该都一样大。
7. 每个ROI的平均光密度计算:IOD/Area。
生物医学常用软件应用技巧
二 24th
一些零星的技巧收集在这儿。
1. 禁止浏览器打开pdf文档。Acrobat或Adobe Reader安装时会给IE内核的浏览器增加pdf浏览插件,但某些以IE作为内核的浏览器内预览pdf文档时常常会停止响应,例如遨游。可以在Acrobat或Adobe Reader里禁止浏览器打开pdf,从而保持在网页内点击pdf文档的链接时直接下载,而不是在浏览器里浏览pdf文档。设置方法: 打开Acrobat或者Adobe Reader软件-菜单“编辑”-“首选项”-“因特网”-取消对“在浏览器中显示PDF”项的选择
2. EndNote与Office 2007的冲突。相信不少朋友已经升级到了Office 2007,如果同时使用EndNote管理参考文献的话,会发现插入了EndNote参考文献的Word文档会变得奇慢无比,常常失去响应。这是EndNote和Word 2007的拼写检查之间的冲突,目前还没有解决这个问题。为了避免冲突,只有割爱关闭Word的拼写检查功能了。设置方法:打开Word,点击窗口左上角“Office按钮”-“校对”页-将“在Word中更正拼写和语法时”下的勾都去掉,最多只可以保留“键入时标记语法错误”。(updated, 2010-6-19)打错了板子,其实冲突只存在于Word 2007的“使用上下文拼写检查”冲突。在Word里关掉这个选项便是。方法:Word 2007界面左上角的球 – Word 选项 – “校对”页 – 去掉“使用上下文拼写检查”前的勾。
3. SPSS 16.0以上的版本的使用的常见统计功能不见了。尽管你已经确认这个版本的SPSS已经完全xx了,但是但是Fisher确切概率法检验和生存分析等常用功能在analysis菜单下却找不到了。其实,高版本的SPSS的授权方式发生了改变,确切概率法和生存分析模块的使用是需要独立授权,需要额外的授权号。不过xx组织已经给我们做好了,以EDGE的Keygen为例,在Lock code里可以选择相应的模块来获取授权号,如图所示。

使用Word 2007更新blog
二 8th
离线编辑blog日志一直是我的一个小小的良好愿望,也曾经做过一些尝试。最初使用后台更新,网络和浏览器的不够稳定,总让我觉得很不靠谱。再后来使用Word编辑好之后再粘贴过去,SEO信息和摘要、tag、分类等再人肉填写。期间还尝试过EverNote,但是中文键入让人很难忍。也试过专门的离线blog同步软件Zoundry Raven,记不得是跟我的blog有哪儿的一点不和谐,就放弃了。其间见到过WordPress for Android和for BB的版本,口水不已。我现在使用的主力手机是个PPC,被鄙视在外。今天在小众软件提到使用QTM更新blog,支持WordPress平台,不过遗憾的是,我对html的人肉编辑太弱。看到这篇日志的文末提到Live Writer,我这个WordPress菜鸟显然不懂这个,Google了一下,才知道原来是微软官方的离线blog编辑工具。这让我忽然想起来,在07版的Word里,新建一个Word文档时,总会提示是空白文档还是博客文章,后者一直被我无视着。
回到Word 07,试用了一下,并用这个功能发布了本日志,效果不错,图片也可以完整的贴过来。不过我顾虑还没有消除,日志的分类可以用”插入类别”菜单设置,但是SEO的插件就没法顾及,摘要和tag也没有编辑。难道这些信息还是避免不了的需要人肉到后台去编辑?
再找时间试用了一下Windows Live Writer,光blog发布功能而言,有几点优于Word 07。Writer是免费的;支持类别,而且是树状类别;支持tag;还支持一大堆插件,也有个SEO插件,不过不知道怎么用,但有点是知道的,就是不能跟WP的”All in One SEO Pack”对接上。
updated, 2010-2-10,增加了Windows Live Writer的简单介绍。